?小智等人在經過漫長的旅行之后，所來到的地方是個看起來有點破敗的城市——黑云市，從海面吹來的風聞起來帶著臭泥的氣息，影響路過的心情。
“這個地方工廠林立，可是怎么看起來冷冷清清的”，小霞看著這個城市不解的問。
“這里好像叫做黑云市耶，聽說這里以前因為到處是工廠，所以很繁華哦，但也因為這個原因，所以天空和大海都受到污染，又沒落起來了”，小剛解釋道。
因為小智這次照顧皮丘照顧的很好，而且皮丘是不擅長儲電的神奇寶貝，所以皮丘沒有像動漫中皮卡丘一樣出現電磁鐵化，不過小智他們還是要去神奇寶貝中心。
“有人在嗎？有沒有人在啊”，一路忍受著污染的空氣走到神奇寶貝中心后，小智立刻問道，畢竟還是要恢復神奇寶貝的。
“啊~，真受不了”，這時打著哈欠的喬伊出來了，不過是沒精打采的樣子，“你不知道現在幾點鐘嗎？普通好孩子這個時候都已經睡覺了”，喬伊小姐繼續(xù)說道。
“對不起啊”，小智也知道現在挺晚的，所以不好意思的說道。
“喬伊小姐，我的神奇寶貝就拜托你了”，想要恢復神奇寶貝的體力，所以只好托付給喬伊小姐了。
“啊~啊~，好吧”，喬伊小姐繼續(xù)打著哈欠的說道，根本就沒有把照顧神奇寶貝當做重要的事情，就隨便的收下了。
“我說……我想要說的是，有人跟我說你是眾姐妹中最怪的一個”，這時小霞對喬伊小姐說道，而小智這時也發(fā)現小剛居然這次沒有犯花癡，難道是因為這個原因，看來小剛不是對所有的美女大姐姐都有興趣的。
“不對，他們才是奇怪的呢”，喬伊小姐聽了小霞的話后笑著說道，小智和小霞、小剛頓時無語。
“怎么回事？”可是就在這時，突然間燈熄掉了。
“好像是停電了”，小剛則是說道。
“這些是治療中的神奇寶貝，電力如果在不快點恢復的話，它們就有危險了”，小智他們跟著喬伊小姐到了里屋后，喬伊小姐看著許多的神奇寶貝擔心的說道。
“這里的發(fā)電廠在什么地方？”小智知道現在事情緊急，所以立刻問道。
“發(fā)電廠？”小霞聽了小智的問話，立刻重復的說道，有點稍微的不解。
“小霞，停電的問題是出在發(fā)電廠，小智說的沒錯”，小剛給小霞解釋說道。
“就是那個有大煙囪的工廠”，喬伊小姐通過窗戶指著一座又高大煙囪的工廠說道。
“好，我們走”，又從喬伊手中接過自己的神奇寶貝，小智說完就出發(fā)了，大家就向發(fā)電廠跑去。
“這里是發(fā)電廠”，經過一路奔跑，小智等人終于到了發(fā)電廠。
“有人在嗎？有沒有人在里面??？如果沒人在的話，我們就要進去了”，打開門后，看到黑漆漆空蕩蕩的屋子，小智就大聲的喊道，可是卻沒有人回應，便向里繼續(xù)行走。
“我猜這里應該是有員工在某個地方管理的吧”，小剛邊走邊說道。
“那個地方是中央控制室”，小霞則是在看完墻上的地圖后指著前方的房間說道。
“好像有東西跟著我們”，走在去往中央控制室的走廊上，小剛突然對小智和小霞說道。
“沒有東西啊，是不是你過敏啊”，而小霞在四處看了看之后發(fā)現沒有什么東西，于是對小剛說道。
“可是我真的感覺有東西跟著我們啊”，小剛則是堅信自己的想法。
不知道為什么小磁怪還是出現了，“是小磁怪耶”，看到小磁怪后小霞說道，“不過它為什么會在這里呢”。
“會不會就是它使發(fā)電廠停電的呢”，小剛猜測道。
“不知道”，小智聽后則是搖搖頭，雖然他早就知道停電是由于臭泥和臭臭泥造成的。
“既然這然，你就只能收服了，然后再調查看看”，小剛看到小智沒有收服的傾向，而且又不是水系的，小霞也不會收服，所以說到。
“上吧，六尾”，小剛派出的神奇寶貝是六尾，“六尾，使用噴射火焰”，火系對鋼系效果拔群，所以小剛讓六尾使用了噴射火焰，而小磁怪還沒有反應過來就被打中了，“去吧，神奇寶貝球”，小剛隨后扔出了寶貝球，成功的收服了小磁怪。
“我收服小磁怪了”，小剛高興的拿起小磁怪的寶貝球。
“好了，趕快走吧，神奇寶貝中心的神奇寶貝們還等著我們呢”，小智看到小剛收服新的神奇寶貝也很高興，不過想到生病的神奇寶貝還在等著，于是就立刻說道。
“你們有沒有聞到什么臭味啊”，而就在這時小霞突然捂著鼻子對小智和小剛說道。
“好像有耶”，小智和小剛這時也聞到了。
然后就聽到后面‘砰’的一聲，天花板上的通風窗欄桿掉了下來，然后就出來了好多的神奇寶貝。
“臭死了，就是他們”，小霞看著這些神奇寶貝說道。
“是臭泥啊”，小智看到出現的一大群臭泥，就知道見到造成停電的主角了。
“嗚啊~”，而這時隨著越來越多的臭泥的出現，一只比臭泥大的神奇寶貝出現了。
“啊，這么大，是臭泥的老大嗎”，已經臭的不行了，突然又出現了一只老大，小霞更加不能忍受的說道。
“臭死了，真的是臭死了”，小霞最后實在受不了的說，然后就看到臭臭泥開始指揮者臭泥攻擊小智他們，小智等人就只好跑路了，跑著跑著就碰到了工作人員，大家就一起跑到了控制室，可臭臭泥一直指揮臭泥撞門，最終們還是被撞壞了。
“怎么辦？”小霞看到這種情況后有點慌亂，而小智本來想派出所有的神奇寶貝來戰(zhàn)斗的。
“是小磁怪和三合一磁怪”，可是就在這時突然出現了好多的小磁怪和三合一磁怪，小剛看到后立刻說道，然后小磁怪和三合一磁怪一起放電，把臭泥們都趕跑了。
“等一等，還有一只留下來了”，就在大家歡呼的時候，小霞指著一邊說道，“是臭泥的老大，臭臭泥”，原來臭臭泥沒有走，還在那里。
“好，凱西，就決定是你了”，小智派出凱西來迎戰(zhàn)。
“使用念力”，超能系對毒系效果拔群，所以小智讓凱西使用念力來攻擊，而臭臭泥中了這招后，非常的痛苦。
“繼續(xù)，加強輸出，好，去吧，神奇寶貝球”，終于在臭臭泥非常疲倦的時候，小智扔出寶貝球收服了臭臭泥，并隨后把它傳回了大木博士研究所。
“太好了，我收服臭臭泥了”，小智再次收服了新的神奇寶貝，非常的高興。
不過事情真的結束了嗎？“…………（火箭隊經典臺詞）”，就在小智他們走出發(fā)電廠后，火箭隊的暴鯉龍潛水艇登場了。
“皮丘，十萬伏特”，小智覺得在臭泥們追逐下已經很累了，實在沒有多余的精力來和火箭隊玩了，所以立刻就讓皮丘使用了十萬伏特。
“皮丘~”，而隨著皮丘的一聲叫聲，黃色的電流向火箭隊攻去。
“好討厭的感覺啊，我們這次的出場好短啊”，在抱怨中，火箭隊飛走了。
“臭泥的大量出現就是環(huán)境被污染嚴重造成的，所以以后的環(huán)境就靠你們了”，天亮后，回到神奇寶貝中心，小智對喬伊小姐和趕來的君莎小姐說道。
“真是慚愧，我以后一定會和大家把環(huán)境早點恢復美麗的”，君莎小姐保證的說道。
“謝謝你們，都是托你們的福，神奇寶貝才能恢復健康的，我以后也會好好的照顧神奇寶貝的”，而后喬伊小姐也說道。
“哪里哪里……，我們要繼續(xù)旅行了，那再見了”，隨后告別了喬伊和君莎小姐，小智和小霞、小剛再次踏上了旅途。